معاونت سیاستگذاری، راهبری و نظارت بر امور زیربنایی و اقتصادی مأموریت هدایت امور زیربنایی، تولیدی، اشتغال و توسعه پایدار در روستاها، عشایر و مناطق محروم کشور را بر عهده دارد. این معاونت با اتکا به سه دفتر تخصصی، مسیر تقویت زیرساخت‌ها، توانمندسازی اقتصادی و تحقق عدالت متوازن را دنبال می‌کند. در همین چارچوب، هماهنگی با استان‌ها و دستگاه‌های اجرایی، شناسایی و پیگیری طرح‌های عمرانی و اقتصادی، تسهیل سرمایه‌گذاری و اشتغال، و پایش شاخص‌های توسعه پایدار در دستور کار قرار دارد تا منابع و برنامه‌ها به‌صورت هدفمند در خدمت آبادانی مناطق روستایی، عشایری و محروم به کار گرفته شوند.